新型lncRNA MANTIS通過表觀遺傳調控促進內皮細胞血管生成
長鏈非編碼RNA（lncRNA）可在表觀遺傳水平、轉錄水平和轉錄后水平調控編碼基因的表達，從而控制不同的生物過程。目前對lncRNA在表觀遺傳水平上的調控機制了解甚少。近期，德國歌德大學醫(yī)學系的Ralf P. Brandes團隊發(fā)現(xiàn)了新型lncRNA MANTIS，并描述它在表觀遺傳學調控中的作用。相關研究結果以“Long Noncoding RNA MANTIS FacilitatesEndothelial Angiogenic Function”為題發(fā)表在Circulation雜志上，雜志影響因子19.3。
背景：內皮細胞的血管生成功能受到許多機制的調控，但長鏈非編碼RNA（lncRNA）對血管內皮細胞的影響幾乎沒有被研究。研究人員著手鑒定新型和功能重要的內皮細胞lncRNAs。
材料：人臍靜脈內皮細胞（HUVEC）和其他細胞，血管高壓病人和健康肺組織，膠質母細胞瘤和健康人腦周圍組織內皮細胞，獼猴血管，小鼠和大鼠動物模型。
方法：LNA-GapmeRs, siRNAs 或 CRISPR/Cas9敲除；Affymetrix Exon-Array；Illumina BeadChip Array；RNA原位雜交；RNA Pulldown；熒光素酶報告基因實驗；免疫沉淀；質譜；RNA-seq;轉座酶無障礙染色質測序（ATAC-Seq）和染色質免疫沉淀。
結果：發(fā)現(xiàn)新型lncRNAMANTIS在特發(fā)性肺動脈高壓（IPAH）患者中下調，它與SWG / SNF染色質重塑復合物的催化亞基BRG1相互作用，維持持BRG1活性的ATP酶功能，調控核小體重塑。因此，MANTIS通過確保有效的RNA聚合酶II機械結合，調控血管內皮關鍵基因的轉錄。
研究思路：
1. 篩選和鑒定內皮血管生成相關lncRNA
H3K4組蛋白脫甲基酶(JARID1B)已被證明通過限制基因阻遏蛋白的表達來維持正常的內皮基因表達，作者在靜脈內皮細胞（HUVEC）中敲除JARID1B，利用外顯子芯片篩選血管內皮相關lncRNA。
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